Εκτός από τη μόνιμη έκθεση των συλλογών στα δύο κεντρικά του κτήρια η εκθεσιακή πολιτική του Μουσείου εξαπλώνεται και σε πολλά άλλα επίπεδα.
Περιλαμβάνει:
α) οργάνωση εκθέσεων νεοελληνικής τέχνης του 20ού αιώνα με πανελλήνιο ή διεθνές βεληνεκές,
β) εικαστικές επεμβάσεις πρωτοποριακού χαρακτήρα,
γ) φιλοξενία εκθέσεων επιφανών ελλήνων και ξένων δημιουργών, ιστορικών ντοκουμέντων κ,ά,
δ) διοργάνωση και υποστήριξη εκθέσεων εικαστικών καλλιτεχνών δωδεκανησιακής καταγωγής.